En 1993 comienza la primera temporada de la serie Star Trek Deep Space 9. Es la primera obra oficial de Star Trek que no fue creada por Gene Roddenberry, quien murió dos años antes. Durará siete temporadas. En lugar de una nave, como las otras series, la historia se desarrolla alrededor de una estación espacial. Tiene cierta importancia en el juego Star Trek Online, ya que en sus alrededores se desarrollan dos arcos narrativos. Incluyendo lo último. El juego tiene lugar 35 años después del final de la serie, un pequeño recordatorio (con spoilers) de los elementos que aún corren en esta historia.
La estación fue construida en 2351 por la Hegemonía Cardassiana en el sistema Bajor. Llamado Terok Nor, tenía dos objetivos: administrar el área minera circundante y controlar a la población local que no aceptaba la ocupación militar. En 2369, después de unos meses de guerra contra la Federación Unida de Planetas, la Hegemonía tuvo que abandonar el sistema. Bajor es independiente, pero la estación está bajo el control de la Federación. Como está fuera de las fronteras del momento, toma el código Deep Space. El noveno de la serie. El oficial a cargo se convierte en el comandante Benjamin Sisko. Algunas de sus tropas abandonan la Academia de la Flota Estelar. Sus veteranos son transferidos principalmente del USS Enterprise D. Tiene que lidiar con el gobierno bajorano independiente, que exige que participen los oficiales de su nuevo ejército. Finalmente está Odo, un alienígena cambiaformas de origen desconocido que ocupó el puesto de jefe de seguridad de los cardassianos y que impresionó a los bajoranos lo suficiente como para pedirle que mantuviera este papel. Además de las necesidades diplomáticas, Deep Space 9 debe gestionar la presencia de un agujero de gusano o vórtice hacia el cuadrante Gamma y, por tanto, servir como relevo para las misiones de exploración. Por lo tanto, se convirtió en uno de los principales puntos de reunión de la Federación en el Cuadrante Alfa (si no el).
Un destino curioso es el del comandante (luego capitán) Benjamin Lafayette Sisko. Nacido en Nueva Orleans en la Tierra, estudió ingeniería en la Flota Estelar. Un veterano de la Guerra Borg, sobrevivió a la Batalla de Wolf 359 donde un solo Cubo Borg destruyó 39 naves de la Flota Estelar. Las familias de las tripulaciones estaban a bordo, logró salvar a su hijo Jake pero perdió a su esposa. También participó en el diseño del modelo Defiant en los astilleros de Mars. Un ex superior lo convence de unirse al mando de la Flota Estelar (y por lo tanto de cambiar de amarillo a rojo), lo que significa que se encuentra a la cabeza de Deep Space 9. Allí, descubre que las profecías bajoranas hablan de él. Él sería el Emisario, un ser que debería ayudar a sus dioses bautizados Profetas a derrotar a sus enemigos. También desaparecerá al cumplir esta profecía.
El entonces comandante Capitán Sisko tuvo varios problemas que manejar durante los 7 años de su mandato al frente de Deep Space 9. Además de Bajor, que era deseable que se uniera a la Federación (se hizo una primera solicitud en 2373 pero se pospuso debido a la guerra en curso, la segunda en 2375 llevó a la integración oficial al año siguiente), Cardassia siguió siendo un vecino delicado de administrar. De hecho, la Hegemonía atravesaba una crisis política entre militaristas y un joven movimiento democrático. También surgieron problemas en el lado de las Federaciones con la formación de los Maquis. A algunos colonos les disgustaban partes del tratado de paz, fundaron una organización terrorista escondida en la vecina zona de Badlands. Varios oficiales de la Flota Estelar de nivel medio desertaron para llenar sus filas. Pero la mayor amenaza provino del cuadrante Gamma. Los exploradores de la Flota Estelar atrajeron la atención de una entidad política llamada Dominio y gobernada por cambiaformas de la misma raza que Odo. Atacaron el Cuadrante Alfa. Los profetas bajoranos inmovilizaron una flota haciéndola desaparecer en el vórtice entre los cuadrantes, pero otras naves pasaron. Sus soldados arrasaron las bases de los Maquis. Instaron a los klingon a invadir Cardassia para hacer aliados. También se aliaron con los Breen. La Guerra del Dominio duró desde 2373 (aunque las primeras escaramuzas comenzaron en 2370) hasta 2375 cuando la unión de la Federación, el Imperio Klingon y el Imperio Romulano capturaron a uno de los líderes enemigos y obligaron a firmar el Tratado de Bajor sobre el Espacio Profundo 9.
Tras la desaparición del Capitán Sisko, es su brazo derecho, el coronel bajorano Kira Nerys, quien lo sucede por un tiempo. Cuando deja el ejército para convertirse en un alto clérigo, Starfleet envía al capitán James Kurland. Bajor se incorporó a la Federación, ya no existe ni siquiera una obligación de dirección y gestión mixta. El Maquis ha desaparecido. La reconstrucción de Cardassia ha llevado a los demócratas de Natima Lang y Elim Garak. Exespía, este último vivió durante mucho tiempo en Deep Space 9 como sastre y está al frente de una gran empresa textil. En 2393, el militarista Madred, políticamente derrotado, se alió con los disidentes del Dominion para formar la organización terrorista True Path, pero sus acciones no se limitaron solo al sector. Las Badlands siguen siendo difíciles de patrullar. En cuanto al Dominio, se retiraron, dejando a uno de los suyos como rehén. Reincorporaron a Odo entre ellos como garantía de ser guiados de otra manera. La estación está, por tanto, bastante tranquila, si no fuera necesario tener en cuenta la presencia klingon impuesta para mantener un cierto equilibrio en la Guerra Fría entre las dos potencias.
Uno de los lugares más famosos de la estación Deep Space 9 es el bar Quark, llamado así por el Ferengi que lo ha dirigido durante años. Su madre se había casado con el Gran Nagus, el jefe de estado de su pueblo. Empujó a Rom, su otro hijo, como sucesor. Rom, que había trabajado para su hermano antes de convertirse en ingeniero entre los bajoranos que trabajaban en la estación. Rom cuyo hijo Nog se unió a la Flota Estelar y el primer ferengi en hacerlo (Ferenginar no es parte de la Federación, pero la Flota Estelar tiene un programa especial para algunos estudiantes). Nog, que ahora es el capitán del USS Chimera. Rom se casó con Bajoran Leeta, que era mesera en el bar de Quark. Cuando dejó Deep Space 9, Quark se convirtió en el asesor de su hermano. También es el director de una empresa de Dabo que utiliza la holoimagen de su cuñada. Otro gobierno afectado por lo ocurrido en esta emisora.
En Star Trek Online, Deep Space 9 es un transporte rápido que se desbloquea al elevar su diplomacia / incursión (dependiendo de la facción) al rango 4. La estación está involucrada en dos campañas. El primero requiere lidiar con una consecuencia de la guerra del Dominio en las afueras del espacio cardassiano. Más recientemente, en la temporada 11 New Dawn, el Imperio Terrano del Universo Espejo se lanza en incursiones desde un punto cercano. ¿Y quiénes serán los capitanes encargados de solucionar estos problemas?
